Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sorbs3Q9R1Z8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms