Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrg1Q9R0Y8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabrg1Q9R0Y8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabrg1Q9R0Y8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms