Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mpdu1Q9R0Q9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms