Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fhl3Q9R059 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhl3Q9R059 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms