Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms