Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf4Q9QZS2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf4Q9QZS2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms