Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms