Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tnnt3Q9QZ47 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt3Q9QZ47 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms