Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Map1aQ9QYR6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms