Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tomm40Q9QYA2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tomm40Q9QYA2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms