Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms