Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pcsk1nQ9QXV0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pcsk1nQ9QXV0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms