Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg2Q9QXK3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg2Q9QXK3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms