Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2bQ9JME9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms