Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp3a41aQ9JMA7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp3a41aQ9JMA7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms