Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cul3Q9JLV5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms