Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SacsQ9JLC8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms