Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3m1Q9JKC8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3m1Q9JKC8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms