Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms