Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip3Q9JJR9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrip3Q9JJR9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms