Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssna1Q9JJ94 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms