Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup50Q9JIH2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms