Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn2Q9JI91 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn2Q9JI91 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn2Q9JI91 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn2Q9JI91 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn2Q9JI91 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn2Q9JI91 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn2Q9JI91 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn2Q9JI91 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn2Q9JI91 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actn2Q9JI91 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms