Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc5a4aQ9ET37 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4aQ9ET37 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms