Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp6Q9ESX2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp6Q9ESX2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms