Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Brd4Q9ESU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Brd4Q9ESU6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms