Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr61Q9ERF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms