Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Tpcn1Q9EQJ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpcn1Q9EQJ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Tpcn1Q9EQJ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Tpcn1Q9EQJ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Tpcn1Q9EQJ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Tpcn1Q9EQJ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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