Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufs3Q9DCT2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ndufs3Q9DCT2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms