Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms