Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms