Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyp27a1Q9DBG1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms