Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc54Q9DAL3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms