Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem239Q9DA47 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms