Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco2Q9DA21 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 508.1 ms