Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms