Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9D9S1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D9S1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D9S1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D9S1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms