Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd9Q9D9M4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzd9Q9D9M4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms