Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms