Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Speer4bQ9D9F7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4bQ9D9F7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms