Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcfc2Q9D968 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms