Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms