Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8L0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms