Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tspan17Q9D7W4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms