Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D7E4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.6 ms