Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms