Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al3Q9D4U4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms