Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms