Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf3Q9D4H7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms