Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eaf1Q9D4C5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eaf1Q9D4C5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms